MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017857	CAA	2	6	260594	260599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126147
5002	NC_017857	CACC	2	8	260627	260634	25 %	0 %	0 %	75 %	387126147
5003	NC_017857	TGGTT	2	10	260640	260649	0 %	60 %	40 %	0 %	387126147
5004	NC_017857	GAT	2	6	260661	260666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126147
5005	NC_017857	ATGG	2	8	260682	260689	25 %	25 %	50 %	0 %	387126147
5006	NC_017857	GATA	2	8	260804	260811	50 %	25 %	25 %	0 %	387126147
5007	NC_017857	ACC	2	6	260914	260919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126147
5008	NC_017857	GAT	2	6	260933	260938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126147
5009	NC_017857	ACA	2	6	260966	260971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126147
5010	NC_017857	AAAC	2	8	261001	261008	75 %	0 %	0 %	25 %	387126147
5011	NC_017857	ATC	2	6	261016	261021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126147
5012	NC_017857	TAA	2	6	261089	261094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017857	CAA	2	6	261121	261126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017857	T	6	6	261165	261170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017857	AAC	2	6	261215	261220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126148
5016	NC_017857	TGC	2	6	261269	261274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126148
5017	NC_017857	GCAG	2	8	261392	261399	25 %	0 %	50 %	25 %	387126148
5018	NC_017857	AAC	2	6	261421	261426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126148
5019	NC_017857	GGT	2	6	261432	261437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126148
5020	NC_017857	GGC	2	6	261440	261445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126148
5021	NC_017857	ATGCAA	2	12	261450	261461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387126148
5022	NC_017857	CTA	2	6	261463	261468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126148
5023	NC_017857	TGC	2	6	261497	261502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126148
5024	NC_017857	TAC	2	6	261504	261509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126148
5025	NC_017857	AAAT	2	8	261519	261526	75 %	25 %	0 %	0 %	387126148
5026	NC_017857	CTG	2	6	261530	261535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017857	AT	3	6	261576	261581	50 %	50 %	0 %	0 %	387126149
5028	NC_017857	GCTC	2	8	261652	261659	0 %	25 %	25 %	50 %	387126149
5029	NC_017857	ATA	2	6	261660	261665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126149
5030	NC_017857	ACG	2	6	261681	261686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126149
5031	NC_017857	GGC	2	6	261703	261708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126149
5032	NC_017857	A	6	6	261726	261731	100 %	0 %	0 %	0 %	387126149
5033	NC_017857	GATT	2	8	261732	261739	25 %	50 %	25 %	0 %	387126149
5034	NC_017857	AGA	2	6	261754	261759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126149
5035	NC_017857	AATT	2	8	261792	261799	50 %	50 %	0 %	0 %	387126149
5036	NC_017857	ATC	2	6	261969	261974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126149
5037	NC_017857	TGTT	2	8	261987	261994	0 %	75 %	25 %	0 %	387126149
5038	NC_017857	A	6	6	262028	262033	100 %	0 %	0 %	0 %	387126149
5039	NC_017857	CAGAAA	2	12	262049	262060	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387126149
5040	NC_017857	GCA	2	6	262108	262113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126150
5041	NC_017857	GGC	2	6	262122	262127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126150
5042	NC_017857	ACTG	2	8	262200	262207	25 %	25 %	25 %	25 %	387126150
5043	NC_017857	ACA	2	6	262233	262238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126150
5044	NC_017857	AAC	2	6	262253	262258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126150
5045	NC_017857	GTA	2	6	262324	262329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126150
5046	NC_017857	GTG	2	6	262418	262423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126150
5047	NC_017857	CTGG	2	8	262447	262454	0 %	25 %	50 %	25 %	387126150
5048	NC_017857	AAAC	2	8	262459	262466	75 %	0 %	0 %	25 %	387126150
5049	NC_017857	TAT	2	6	262476	262481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126150
5050	NC_017857	ACCGG	2	10	262504	262513	20 %	0 %	40 %	40 %	387126150
5051	NC_017857	AAC	2	6	262559	262564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126150
5052	NC_017857	CTG	2	6	262600	262605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126150
5053	NC_017857	GAT	2	6	262654	262659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126150
5054	NC_017857	A	6	6	262690	262695	100 %	0 %	0 %	0 %	387126150
5055	NC_017857	CAGCA	2	10	262721	262730	40 %	0 %	20 %	40 %	387126150
5056	NC_017857	CG	3	6	262747	262752	0 %	0 %	50 %	50 %	387126150
5057	NC_017857	TGC	2	6	262796	262801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126150
5058	NC_017857	GGCA	2	8	262808	262815	25 %	0 %	50 %	25 %	387126150
5059	NC_017857	TTA	2	6	262915	262920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126150
5060	NC_017857	A	6	6	262939	262944	100 %	0 %	0 %	0 %	387126150
5061	NC_017857	CCAA	2	8	262951	262958	50 %	0 %	0 %	50 %	387126150
5062	NC_017857	AGGC	2	8	262985	262992	25 %	0 %	50 %	25 %	387126150
5063	NC_017857	TAT	2	6	263016	263021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126151
5064	NC_017857	GCC	2	6	263033	263038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126151
5065	NC_017857	CCA	2	6	263134	263139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126151
5066	NC_017857	T	6	6	263165	263170	0 %	100 %	0 %	0 %	387126151
5067	NC_017857	CAGC	2	8	263185	263192	25 %	0 %	25 %	50 %	387126151
5068	NC_017857	TGC	2	6	263241	263246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126151
5069	NC_017857	TGG	2	6	263247	263252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126151
5070	NC_017857	TA	3	6	263254	263259	50 %	50 %	0 %	0 %	387126151
5071	NC_017857	GCC	2	6	263291	263296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126151
5072	NC_017857	AACA	2	8	263330	263337	75 %	0 %	0 %	25 %	387126151
5073	NC_017857	CAG	2	6	263384	263389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126151
5074	NC_017857	A	7	7	263400	263406	100 %	0 %	0 %	0 %	387126151
5075	NC_017857	CTGA	2	8	263408	263415	25 %	25 %	25 %	25 %	387126151
5076	NC_017857	CAA	2	6	263506	263511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126151
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5080	NC_017857	GCC	2	6	263588	263593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126151
5081	NC_017857	TTTGC	2	10	263657	263666	0 %	60 %	20 %	20 %	387126151
5082	NC_017857	CAA	2	6	263711	263716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126151
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5085	NC_017857	CCAA	2	8	263810	263817	50 %	0 %	0 %	50 %	387126151
5086	NC_017857	AATT	2	8	263820	263827	50 %	50 %	0 %	0 %	387126151
5087	NC_017857	TCAG	2	8	263838	263845	25 %	25 %	25 %	25 %	387126151
5088	NC_017857	GCA	2	6	263906	263911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126151
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5090	NC_017857	ATTG	2	8	263962	263969	25 %	50 %	25 %	0 %	387126151
5091	NC_017857	GAC	2	6	264000	264005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126151
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5093	NC_017857	TAT	2	6	264281	264286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126151
5094	NC_017857	GCCT	2	8	264287	264294	0 %	25 %	25 %	50 %	387126151
5095	NC_017857	TCT	2	6	264311	264316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126152
5096	NC_017857	T	6	6	264369	264374	0 %	100 %	0 %	0 %	387126152
5097	NC_017857	ATG	2	6	264379	264384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126152
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5099	NC_017857	AAG	2	6	264457	264462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126152
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5101	NC_017857	TGG	2	6	264537	264542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126152
5102	NC_017857	CAA	2	6	264606	264611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126152
5103	NC_017857	TTG	2	6	264615	264620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126152
5104	NC_017857	TAA	2	6	264688	264693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126152
5105	NC_017857	CCA	2	6	264708	264713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126152
5106	NC_017857	AC	3	6	264729	264734	50 %	0 %	0 %	50 %	387126152
5107	NC_017857	GATT	2	8	264761	264768	25 %	50 %	25 %	0 %	387126152
5108	NC_017857	TTTC	2	8	264804	264811	0 %	75 %	0 %	25 %	387126152
5109	NC_017857	AAAT	2	8	264812	264819	75 %	25 %	0 %	0 %	387126152
5110	NC_017857	TTA	2	6	264911	264916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126153
5111	NC_017857	TGC	2	6	264943	264948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126153
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5113	NC_017857	GTTT	2	8	265113	265120	0 %	75 %	25 %	0 %	387126153
5114	NC_017857	GGA	2	6	265225	265230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126153
5115	NC_017857	ATG	2	6	265295	265300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126153
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5119	NC_017857	ATT	2	6	265439	265444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126153
5120	NC_017857	CGT	2	6	265475	265480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126153
5121	NC_017857	ACA	2	6	265483	265488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126153
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5123	NC_017857	ATG	2	6	265524	265529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126153
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5239	NC_017857	GCAT	2	8	270867	270874	25 %	25 %	25 %	25 %	387126158
5240	NC_017857	TGG	2	6	270930	270935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126158
5241	NC_017857	T	6	6	270942	270947	0 %	100 %	0 %	0 %	387126158
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5493	NC_017857	ACA	2	6	284283	284288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_017857	TC	4	8	284300	284307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5495	NC_017857	GA	4	8	284460	284467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_017857	TCA	2	6	284488	284493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126170
5497	NC_017857	GCTGAT	2	12	284513	284524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387126170
5498	NC_017857	TGA	2	6	284633	284638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126170
5499	NC_017857	GAA	2	6	284649	284654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126170
5500	NC_017857	CGT	2	6	284766	284771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126170

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